Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSD3Q9BZ95 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSD3Q9BZ95 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms