Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM54Q9BYV2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM54Q9BYV2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms