Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPAS2Q99743 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NPAS2Q99743 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPAS2Q99743 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPAS2Q99743 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPAS2Q99743 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPAS2Q99743 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms