Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms