Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VAT1Q99536 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VAT1Q99536 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms