Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CR12Q96Q35 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms