Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC43Q96MW1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms