Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRRC1Q96M27 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms