Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71F1Q96KD3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71F1Q96KD3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71F1Q96KD3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71F1Q96KD3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71F1Q96KD3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM71F1Q96KD3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM71F1Q96KD3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms