Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HIC2Q96JB3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms