Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NMD3Q96D46 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms