Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYTL4Q96C24 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYTL4Q96C24 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms