Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM3DQ96BQ1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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FAM3DQ96BQ1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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FAM3DQ96BQ1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM3DQ96BQ1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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