Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTSSAQ969W0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms