Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PHF3Q92576 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms