Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBXN4Q92575 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBXN4Q92575 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms