Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
FAT3Q8TDW7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms