Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDX54Q8TDD1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDX54Q8TDD1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms