Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NEDD1Q8NHV4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms