Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTLL11Q8NHH1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms