Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARMIL3Q8ND23 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms