Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KBTBD3Q8NAB2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KBTBD3Q8NAB2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms