Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZIC4Q8N9L1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms