Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LMNTD2Q8IXW0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMNTD2Q8IXW0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms