Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HAPLN4Q86UW8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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