Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
WDR53Q7Z5U6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms