Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3BQ7Z3V4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE3BQ7Z3V4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms