Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC29A4Q7RTT9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms