Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms