Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC9Q6ZRR7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC9Q6ZRR7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms