Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ASCL4Q6XD76 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms