Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NANOGP8Q6NSW7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NANOGP8Q6NSW7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms