Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ANKRD40Q6AI12 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms