Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALS2CLQ60I27 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms