Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL1Q5VZK9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL1Q5VZK9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms