Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CC2D1BQ5T0F9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CC2D1BQ5T0F9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms