Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms