Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FRMPD1Q5SYB0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FRMPD1Q5SYB0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms