Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP188Q5SRE5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms