Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC2DQ5SRD0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms