Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFHC1Q5JVL4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms