Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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