Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms