Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPRNQ4KMQ1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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