Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms