Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TWISTNBQ3B726 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms