Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q1T7F1 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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