Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RTN1Q16799 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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RTN1Q16799 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RTN1Q16799 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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