Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FSCN1Q16658 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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