Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NPTX1Q15818 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NPTX1Q15818 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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